Tuy chỉ chiếm tỷ trọng thấp trong cơ cấu kinh tế nhưng với việc tập trung đầu tư ứng dụng công nghệ cao ở những khu vực có thế mạnh về nông nghiệp, lĩnh vực nông nghiệp của Thành phố Hồ Chí Minh sau sáp nhập có sự tăng trưởng tích cực.